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系是浙江大学软件工程硕士研究生培养的建制单位，每个系下设一个或若干个研究方向。目前浙江大学软件学院设立了16个系21个研究方向。
每一个系都与该研究方向紧密相关的一个龙头企业（单位）合作，或者与若干个企业（单位）合作开展产学研一条龙的人才培养。同时，设立满足该专业方向研究生各阶段人才培养的网络互动工程教学实验环境、实训场所和相应的实习基地。
和企业、院校的广泛合作为软件学院提供了丰富的师资。除了浙江大学的教师以外，软件学院的教师还包括合作方教师、国内外其他高校的教师、国内外企业的高级技术和管理人员以及行业和政府管理部门的专家等。
每一个系设立系主任和执行系主任，负责制订和落实下设专业方向的教学计划、各类教师的聘任、实训和实习基地的建设以及教学质量的考核等工作。
研究生入学后因特殊情况需要转专业方向者，由研究生本人提出申请，报学院教务部批准后方为有效。
浙江大学软件学院系和研究方向一览表
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系名 |
下设研究方向 |
面向学生类型 |
合作伙伴 |
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软件技术系
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软件开发技术方向 |
双证、单证在职、单证脱产 |
浙大网新，东蓝科技 |
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软件项目管理方向 |
双证、单证在职、单证脱产 |
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嵌入式系统方向 |
单证在职、单证脱产 |
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信息产品设计方向 |
双证 |
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金融信息技术系 |
金融信息技术方向 |
双证、单证脱产 |
浙江大学道富技术中心 |
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网络工程与管理系 |
网络工程与管理方向 |
单证在职、单证脱产
双证 |
华三通信技术有限公司、浙江华为通信技术有限公司 |
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电子商务技术系 |
电子商务技术方向 |
双证、单证在职、单证脱产 |
阿里巴巴 |
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应用软件开发系 |
应用软件开发方向 |
单证在职、单证脱产 |
微软技术中心 |
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传媒技术系 |
传媒技术 |
双证、单证在职、单证脱产 |
浙江大学传媒与国际文化学院 |
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信息管理系 |
企业信息化管理方向 |
单证在职、单证脱产 |
浙江大学经济学院 |
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金融工程方向 |
单证在职、单证脱产 |
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集成电路系 |
集成电路方向 |
单证脱产 |
浙江大学信息科学和工程学院 |
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电子政务系 |
电子政务方向 |
单证在职 |
浙江大学中国西部发展研究院 |
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网站规划与评测 |
单证在职 |
北京国脉互联信息顾问有限公司 |
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现代物流系 |
现代物流方向 |
单证在职、单证脱产
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香港ETIC |
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对日软件工程系 |
对日软件工程方向 |
单证在职、单证脱产
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东方标准 |
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教育信息化系 |
教育信息化方向 |
单证在职、单证脱产 |
北京中鸿网茂电子商务有限公司、中国教育技术协会 |
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电子商务管理系 |
电子商务管理方向 |
单证在职、单证脱产
双证 |
中国电子商务协会 |
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商务智能技术系 |
商务智能技术方向 |
单证在职、单证脱产 |
Oracle（甲骨文）公司 |
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软件服务系 |
软件服务方向 |
单证脱产
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神州数码 | | 
